军事科学院建院40余年来,取得了许多重要的研究成果,其中主要的有:编写和修订人民解放军合成军队条令、条例;开展国防建设、军队建设和作战重大现实问题的研究,为中央军委和总部提供了一批研究报告;撰写了《战略学》、《战役学纲要》、《国家军制学》、《中国人民解放军战史》、《中国人民志愿军抗美援朝战史》、《中国军事史略》、《孙子兵法新注》等重要军事著作;同时,在计划协调全军的军事科研工作方面做了大量工作,组织全军制订了人民解放军“七五”、“八五”、“九五”军事科研工作计划,申报了国家哲学社会科学五年规划和年度基金研究课题,开展了全军军事科研优秀成果的评奖工作,对推动和发展军事科研事业做出了贡献。
1972年,叶剑英不再任军事科学院院长及政治委员后,历任院长为:宋时轮、郑文翰、蒋顺学、赵南起、徐惠滋、刘精松、王祖训、葛振峰、张定发;历任政治委员为:粟裕、王树声、王新亭、廖汉生、刘志坚、萧华、袁升平、梁必业、王诚汉、杨永斌、张序三、张工、温宗仁。现任院长:郑申侠,政治委员:刘源